Несмотря на близость села Васильевского (всего 3-4 км), Михайловское всегда было отдельным и достаточно крупным приходом. Каменная церковь начала строится в 1767 году. Что интересно, вперед главного престола был освящен боковой — южный в честь святителя Николая, а центральный Михайловский освятили лишь спустя 20 лет, в 1787 году. Северный придел в честь пророка Илии построен симметрично Никольскому, в 1811 г.

Объемно-пространственная композиция храма типа восьмерик на четверике традиционна для своего времени.

Храм закрыт в 1937 году, колокольня по некоторым данным разобрана во время войны, остался лишь ее нижний ярус, включенный в объемы трапезной. Здание сначала использовалось под клуб, а после было отдано колхозу «Михайловское» под склад. В этом качестве церковь простояла  до конца 1990-х гг.
В мае 2002 года начался ремонт кровли трапезной. На деньги благодетелей в 2003 году были также вставлены оконные рамы в окна трапезной. В этом же году сделана новая кровля на главной апсиде.

Главной задачей сейчас является  реставрация живописи храма. Это очень дорогое и долгое предприятие.